中峰寺在白云峰下，创建于西晋，原是道教的乾明观，海拔762米。东晋时，因观中道士派别纷争，部分道士离观而去，部分继续流在观里。
　　此时，资州人明果禅师受大德开示来到峨眉山宝掌峰，他偶闻观中有妖孽蟒患，骚扰四邻百姓。于是，明果禅师遂约山民来到乾明观，弄清妖孽是蟒患。经过勇射妖蟒，清除妖孽鬼怪，保其四方安宁。此事对道观和山民影响甚大，也令观中道士欣佩，愿归依佛门。后来，明果禅师被道士礼请主持观中之事，禅师主事后便重兴殿宇，改道观为寺院，因寺后白岩峰居中，故取名中峰寺。
　　中峰寺乃山中道观改为佛寺之初始，为峨眉山最早六大古寺之一。唐僖宗中和元年（约公元881年），慧通禅师将中峰寺改建后更名集云寺。北宋仁宗时白水寺僧茂真禅师又扩建寺宇，名曰“中峰禅林”或“中峰古刹”。南宋绍兴年间（公元1131～1162年）密印禅师在此住持说法，增修寺院，后由徒弟别峰禅师继任堂中首座，成为宋、明、清时峨眉山禅风最盛的著名禅院。宋代号称“苏门四杰”的大书法家及诗人黄庭坚，为任叙州太守时在此“习静”。明洪武时惠安和尚曾扩建，后毁于火。明成化三年（公元1467年）蜀昭王重建。明嘉靖时，逐年兴建，规模宏大，丹殿碧寮，占地百亩，园林花圃，秀甲全山。寺院在清代顺治甲申年（公元1644年）毁于匪寇，变为一片荒凉。在百年之中曾重建，规模远不及往昔，从原山门围墙建筑一制遗址看，现有规模不及当年的十之二、三。宋之普贤阁，明之普贤殿，孙思邈所赠药鼎丹灶，程公明笔下的“菩萨”、“竹”等全毁。光绪二十九年（公元1903年）又被火毁，民国五年（公元1916年）重修。现存普贤殿为明末时期遗留，应是峨眉山目前最早木结构建筑，大雄宝殿为清代所建。
　　1990年7月14日，经乐山市人民政府教育工作委员会批准，举办“峨眉山佛学院”，寺院殿堂既是比丘班学僧进行佛事活动的场所，同时，也接待信众敬香礼佛。